Rušičky dronů fungují především na dvou aspektech: za prvé, blokují komunikaci mezi dronem a jeho dálkovým ovladačem; a za druhé, blokování komunikace mezi dronem a pozemní řídicí stanicí. Jádrem obou je vysílat specifické signály rádiových vln, které ruší komunikační spojení dronu, což znemožňuje jeho správné fungování.
1. Blokování komunikace mezi dronem a dálkovým ovladačem
Když uživatel ovládá dron, dálkový ovladač vysílá řídicí signály. Tyto signály jsou typicky přenášeny pomocí metod pulzní kódové modulace (PPM) nebo frekvenční modulace (FM). Rušičky dronů vysílají rádiové vlny se stejnými nebo podobnými frekvencemi, fázemi a modulačními schématy jako tyto signály, ruší signály přijímané dronem a brání mu ve správné interpretaci příkazů dálkového ovladače. I když tedy dálkový ovladač stále funguje normálně, dron nemůže létat podle pokynů uživatele.
2. Blokování komunikace mezi dronem a pozemní řídicí stanicí
Kromě dálkového ovladače lze drony ovládat také na dálku prostřednictvím pozemní řídicí stanice. Pozemní řídicí stanice obvykle naváže datové spojení s dronem a prostřednictvím tohoto spojení přenáší příkazy dálkového ovládání, obrazové informace a další data. Rušičky dronů mohou také narušit běžnou komunikaci na tomto datovém spoji vysíláním rádiových vln o specifických frekvencích, fázích a metodách modulace. Tímto způsobem, i když pozemní řídicí stanice může stále fungovat normálně, dron nebude schopen přijímat žádné příkazy nebo informace, takže nebude schopen plnit své poslání.